まぁ「独自に巡視船もどきの哨戒艦を持つ」と言う無意味な事じゃないだろうなと。

ってことは…

ミサイル砲撃雷撃に必要な諸元をデータリンクで送る「目」として。
哨戒艦と組合せてグレーゾーンな対象船舶（しかも数も多い）の中から、通信傍受や行動監視によって高価値な目標（指揮船）を判別してロックオン。
攻撃は護衛艦なり航空機なり、ご自由に。

特殊作戦の母艦、前線基地として。

くらいが思いつくが…