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20XX年ロシアはNATO諸国に一斉攻撃を開始した
迎撃しようと発進したF-35はロシアのサイバー攻撃によりアビオニクスがウイルス感染し全機墜落する

アメリカ国防総省は、急遽旧式アビオニクスのＦ-14をモスボール状態から復活させ、かってのトップガンたちを緊急呼集した
その知らせは海軍を引退してコロラドで牧場を経営していたアイスマンとシカゴでバーを経営していたマーベリックのもとにも届き
彼らは全てをなげうって招集に応じＦ-14で飛び立った。全てのロシア戦闘機を撃墜するために...