つまるところ「通常動力潜水艦にミサイル搭載して運用してはいけないのか？　それは何故？」ってところに集約されるんだよ。原潜はコスパが高いから。
少なくとも自衛隊は、通常動力潜にミサイルを搭載することに決定している。だけど、そのここと原潜を導入する事の間には相関関係が薄い。