ラプターの時のコンセプトは「ステルス機は空の潜水艦」だったし、
今も基本的に変わらないとするなら、普通に考えて潜水艦を使ってアラート任務はやらないのではないか。少なくとも堂々と見せる形では

アラートというよりはパトロール任務的な運用になるんじゃまいか。平時も常に何機かを滞空させておいて、どこに居るのかは敵からは分からない
それでプレッシャーを与え続ける。というような

となると、たとえステルスが一般的になってもやはり見せる戦力である第4世代機も必要と言えば必要になるのであろうか（有人機である必要はなさそうだけど