>実用機の生産が始まって部隊配備が進むと、2式飛行艇は97式飛行艇と同様の任務に従事した。両飛行艇とも、哨戒飛行中のボーイングB17フライングフォートレスやコンソリデーテッドB24リベレーター(海軍型はPB4Y-1)と遭遇する機会が多かったが、特にアメリカ海軍の長距離哨戒爆撃中隊が主力装備としていた後者との空戦は度々起こった。かような状況下では、2式飛行艇は防弾も火力も97式飛行艇より優れており、ゆえに生残率も高く、時にPB4Y-1を撃墜している。