12000ってどこから出てきた数字だ？

日本軍関係の資料からは約8万人〜10万人以上
中国軍関係の資料からは約8万人
慈善団体の埋葬資料からは長江に流された
犠牲者を除いて188,849人あるいは218,849人

という数字が導き出されているので、少なくとも20万人前後の中国軍民が犠牲になったと考えるのが妥当なんだよ

ちなみに
日中が全面戦争に入る前の南京の人口は100万人以上、虐殺が起きた1937年は3月末の時点で1,019,667人(首都警察調べ)、虐殺の翌年1938年2月末の時点で約20万人(南京市自治委員会と特務機関による推定)となっている

そもそも日本の外務省ですらホームページで「日本政府としては、日本軍の南京入城（1937年）後、非戦闘員の殺害や略奪行為等があったことは否定できないと考えています。」と書いてる