とにかく役場がなんと言おうと一番大事なのは赤ちゃんの健康だから
よっぽどミルクも母乳も飲めなくて小さい子ならともかく
小児科医に相談してまだ早いって言われてるなら
役場にその旨言うなり黙ってあげてるふりするなりでいいと思うよ