やってみるとジオメトリ削除だと境界部分がメッシュのギザギザになるので徐々に現れる感がないかも

●ジオメトリ削除＋ジオメトリノードの結果をシェーダーに渡して透過につなぐ方法
https://i.imgur.com/FCbNJym.jpg

●シェーダーノードの透過だけで実現
https://i.imgur.com/FljTc3s.jpg

こんな感じで境界をぼかしたほうが良さそうな気がします。用途次第ですが