一つ質問していいですか？
まず2Dプロジェクトを作るとします
そこに3Dモデルをインポートしてシーンに配置します
そして実行します
そうしたら普通にゲームビューに3Dモデルが表示されますよね？
これって何か不都合ありますかね？
「2Dのゲームに3Dモデルを使用する」という事ですけど。
問題が無いのでしたら基本2Dでゲームを構築してキャラクターだけ3Dで行きたいとか
考えてます