>>230
＞文面から配列にはGameObjectが入っているものと推測する
その通りです。
＞それで変数Aや変数Bを定義してるコンポーネントはHogehogeクラスとする
Hogehogeクラスとします。

＞この場合、配列はGameObject[]ではなくHogehoge[]でないといけない

ここの意味が理解できません。
ゲームマネージャークラス内で宣言した配列に、オブジェクトを入れています。
Hogehogeという名の配列はどこにも存在していません。
それでもHogehoge[]を記述できるんですか？
でも
for (int i = 0; i < 28; i++)
{
if(Hogehoge[i].変数A < 2){
Hogehoge[i].変数B = true;
}
}
ではエラーになりました。
「「Hogehoge」はタイプです。指定されたコンテキストでは無効です」というエラーです。

Hogehoge hooo = 配列[i].GetComponent<Hogehoge>();を使う場合だと
「型または名前空間名 'Hogehoge' が見つかりませんでした」とエラーになります。

＞GameObjectはGameObjectの情報しか持ってないので、
＞Hogehogeの変数を参照しないとHogehogeの情報にはアクセスできない

ここの理屈は理解できます。。。
記述するとき「配列[1].Hogehoge.変数A」見たくなる感じですか？