シリアルを確認。XA26483 ＝　主人公のレイヤードの住民番号
登録確認　＝　第二のレイヤードの住民として主人公を認可
システム起動224フェイズ　＝　人類再生プログラムの開始
最終フェイズをクリア　＝　人類再生プログラムの完了



つまり3でやった人類の復興プログラムを1ミッションに凝縮したのがSLのラストミッション
SLのレイヤードは住民が滅んでしまったから代わりに主人公が再生プログラムを完了させた
という意味
これも近年出た資料で明らかになったことだから意味不明言われるのも仕方ない