wosignのルート証明書は普通のWindowsにも入ってるよ

GPDPocket以外のwindowsPCでcertlm.mscを起動してwosign検索してみ
信頼されたルート証明書に出てくるから

GPDPocketを

クリーンインストールしても、Windowsが入れるだろう

消したいなら上記ツールから該当の証明書右クリックで消せる