>>313
>どうもエラーログ的にPcieの初期化に失敗してるっぽい
>(PERR/SERR エラー)

試しに BIOS の PCI Express Configuration サブメニューからパラメータを調整してみると振る舞いが変わりませんかね?
Link スピードを落としてみるとか