救国軍事会議のいう国家の存亡＝自由惑星同盟の存亡で、
自由惑星同盟の滅亡＝銀河帝国による支配＝民主共和制の終焉なんだよ。

自由惑星同盟の建国の理念が民主共和制の実現だといっても、
一時的または局所的に民主共和制を停止したとしても、
最終的に民主共和制を実現させるなら問題ない。
たとえば、同盟軍内で作戦行動を決める時、投票なんか一切していない。
軍隊内という局所的な部分では民主共和制を停止させていることになるが、
軍隊全体を文民統制できている限り問題にならない。

コレは作中の話ではないけれど、民主国家においても、
戦時に大統領に非常大権を持たせたり、戒厳令や国家総動員体制を作ったりすることはできる。