から生成される二つのjsファイルを単純に連結して一つのファイルにします。
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var mod;
(function (mod) {
　　function func1() {
　　　　alert('func1');
　　}
})(mod || (mod = {}));

var mod;
(function (mod) {
　　function func2() {
　　　　alert('func2');
　　}
})(mod || (mod = {}));
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こういう単純な例だと問題は無かったのですが、実際の状況では連結したJSの実行時にエラーする場合がありました。
少し調べた限りでは、エラーの有無はJSファイルを連結する順番に依存するようなのですが、そういう事はありますか？
やりたいのは、複数のJSファイルをmoduleで囲ってTS化して、そうやって出来上がったJSファイルを一つのファイルに連結したいのですが、エラーが出て行き詰っています。
こういうやり方は間違いですか？