I/Fの問題だろう
Onigmoの仕様では、\sは
　Unicode以外の場合:
　　\t, \n, \v, \f, \r, \x20
　Unicodeの場合:
　　0009, 000A, 000B, 000C, 000D, 0085(NEL),
　　General_Category -- Line_Separator
　　　　　　　　　　　　　-- Paragraph_Separator
　　　　　　　　　　　　　-- Space_Separator
　ASCII外の文字を含むかどうかは ONIG_OPTION_ASCII_RANGE オプションに依存する。
とある
実際、サクラエディタで試すと、
　2028(LS),2029(PS),
　0009,000a,000b,000c,000d,0085,
　0020,00a0,1680,2000,2001,2002,2003,2004,2005,2006,2007,2008,2009,200a,202f,205f,3000(SS)
がマッチする
なので、サクラエディタはUnicodeで鬼雲を使ってると思われる

Janeの場合でも、StyleはSJISであり、XenoはUnicodeなので
https://egg.5ch.net/test/read.cgi/software/1536058236/515
に対して、\d{6}がマッチするのはXenoのみである