パーシステンス層アーキテクチャパターンの選択
それでは、どのパーシステンス層のアーキテクチャパターンを選択すべきでしょうか？
これは、ドメイン層のアーキテクチャパターンの選択に大きく依存します。PoEAAでは、以下の様な組み合が考えられるとしています。

ドメイン層アーキテクチャパターン パーシステンス層アーキテクチャパターン
Transaction Scriptパターン Row Data Gatewayパターン
Table Data Gatewayパターン
Domain Modelパターン Active Recordパターン
Data Mapperパターン
Table Moduleパターン Table Data Gatewayパターン

ドメイン層とパーシステンス層はどの様な組み合わせでもかまいませんが、
より合わせやすいパターンは上記の様な組み合わせといっています。
また、少し視点を変えて各アーキテクチャパターンとシステムの論理的な階層の依存関係を表すと以下のように成るかと思われます。

【図】パーシステンス層/ドメイン層アーキテクチャパターンの依存関係

かなり抽象的かつ感覚的な図ですので、大体の感触をつかんでいただければ良いのですが、
１つ言えることは、システムの論理的な階層である、ドメイン層とパーシステンス層は、
其々異なる役割を持った層ですので、お互いに依存が少ないほうが好ましいと思われます。
その点で言うとDomain ModelとData Mapperがお互いの層で依存関係が少なく済みます。