Perlの利点？
他の言語と同様になんでもできることかな。モジュール色々使うと作るの楽だしOSの違いもかなり吸収されてWindowsでもLinuxでも何も変更せずに動くプログラムも作れる。

シェルスクリプトも外部コマンド動かせば何でもできるとは言えるが、起動のオーバーヘッドの問題や起動しているコマンドの仕様が変わったときに個別に対応しなければいけないなど面倒な事がある。