マニフェストで、uiAccess='true'とし、オレオレ証明書で署名すると、
自アプリに管理者権限がなくても、
管理者権限ありの他アプリがアクティブな時にもマウスのフックが効くようになりました。
(結果的にはスレ違いだったか？)