あと、もう1つ情報を付け加えると、PyinstallerによってMacアプリ化すると
アプリが作成されるのと同時に、サブフォルダに「Unix実行ファイル」というのも作成されています。
何故かアプリでは動かないのに、サブフォルダ内の「Unix実行ファイル」の方をクリックするとファイル生成などのコマンドも正常に動いています。