FreeBSD12でpmbr&gptzfsbootのパターンだが単純にsend&recvで複製してbootfsを設定しておけば
そのディスクがBIOSで起動対象にさえなっていれば起動出来たよ。
正しく設定できれば一回の再起動で別ディスクにルートプールを複製or移動できるはず。