中東の大戦争に介入した米軍は、ロシアから秘密提供されたSu-35数機による奇襲によって海軍戦闘攻撃機を喪失する
行方不明のパイロットは、かつてトップガンの中でも最高と謳われたマーベリックの最後の生徒だった
引退後PMCで第三国の戦場を戦闘機パイロットとして渡り歩いていたマーベリックに海軍が接触
非対称戦のなかで錆びついていた心に火が付いた彼は、米軍が用意したF/A-18Cの退役機と秘密支援部隊を率いて、非公式な救出作戦の支援任務に出撃する
マーベリックによる撃墜もあり、順調に完了すると思われた救出作戦だったが、突如出現した敵の電子戦機とSu-35によって劣勢に立たされたマーベリックも撃墜されてしまう
当該国は米国による秘密作戦で攻撃を受けたとしてSu-35のガンカメラ映像を公開し、追い込まれた米国は一端この戦争から手を引いてしまう
撃墜後に敵の捜索部隊から逃れる中でこのニュースを聞いた逃亡中のマーベリックと生徒は、孤立無援のなか自力での脱出を企図
派手なアクションとストームトルーパーの法則、フォースの導きによって辿り着いた敵空軍基地のはずれ、格納庫に眠っていた機体は…