なるほど。モブキャラとか違う背丈のモデルに同じモーションデータを使い回すならHumanoidにするしかないですね
mayaでアニメーション作ってUnityでおかしくなったらUnity上で修正することもできそうだけど
それをやると派生モーション（待機モーションからのエモートなど）がmayaで作れなくなるから、
mayaで作業、Unityで確認、おかしくなってたらmayaで修正、を繰り返すしかないかな