Ruby で、

text = <<"EOT"
<aaa bbb
ccc
ddd>
<eee>
ffff ggg
<hhh
iiii>
EOT

# m option は、multi-line。$1 は、キャプチャー部分。
# [^>]+ は、> 以外の文字が、1文字以上続く
puts text.gsub( /<([^>]+)>/m ) { |matched| $1.gsub( "\n", " " ) }

>>993
>$1.gsub("\n", "")
"" は、" "(半角空白)の間違いだろ