それはEclipseに依存しすぎなのでは？
以前、リポジトリにEclipseプロジェクトの完了ファイルまで入れてる人がいて驚いた
普通リポジトリにはIDE固有の管理ファイルなんて入れないよね
今ならGradleかMaven形式でリポジトリ入れよう

EclipseもIntelliJもGradle、Mavenをインポートできるので開発者ごとに好きなIDEを選べる
IDE固有のプロジェクトファイルをリポジトリ管理してるから全員ローカルのファイルパスも揃えておくとか怖すぎる