機能アップデートを適用すると個人ストアの電子証明書が消える
https://social.technet.microsoft.com/Forums/ja-JP/4f2276df-e855-4117-8fa6-7e90c1789f3a/27231330211245012483125031248712540124881243436969299921237712?forum=win10itprogeneralJP

この問題はすでに既知の問題として記載されました、次の更新を待ってください。
Certificates may not be present after updating to a newer version of Windows 10
https://docs.microsoft.com/ja-jp/windows/release-information/status-windows-10-20h2#1513msgdesc