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共同通信、読売新聞はじめとする各種報道を参考に予想すると

・F-35Bの運用については基本的に地上基地又は南西諸島の小規模空港を拠点とし運用
・離島防衛におけるターンアラウンドタイム短縮のための前身補給基地としていずも型を利用

と言った形かと
いずも型の対潜ヘリ主体という立ち位置は変わらないんじゃない？