正規表現の書き方教えてください。

CentOS 7のサーバーにURLを要求した際、下記のような余計な文字が付きます。付くことがあります。
/ディレクトリ/ファイル名.拡張子%01
/ディレクトリ/desktop.inib%01
/ディレクトリ/desktop.inie%01

またファイル名の後に、
%EE%81%9F%E2%81%80%EE%81%97%C9%84とか
%E6%89%B8%E7%A8%B7%E4%99%BA%E5%A5%97%E3%8D%95%E4%BD%8C%E6%A1%B2%01とか
ファイル名の語尾に不特定の文字が勝手に付く場合もあります。
ディレクトリを要求したときも
ディレクトリの語尾に%E4%84%B7など(これも不特定)が付いてしまうことがあります。

これを除外するには、
正規表現でどのように書けば良いのでしょうか？

よろしくお願いします。