正規化の問題があるといえばあるか。
見た目全く同じファイル名とかUnicodeだと作れちゃうよね。濁点とか半濁点が曲者。
その辺を考慮してくれるテキストエディターでないといつかその内ハマる。
多分WindowsとMac混在で編集するとその時は早めに来る。