>エンジンは常に（たとえ思考中であっても）コマンドの受信ができる必要があります
guiからのコマンドにどういったものがあるのかまではまだ見てないけどバッチ一つじゃ無理だと思う
制御用兼入出力用Aのバッチと思考エンジンBのバッチの最低2つは要るんじゃないかな
Bは候補手をtmpに書き出し続けてguiから時間て言われたらAがtaskkillしてtmp読み取りして返すとか
これでもgui側でコマンド送る最低間隔何秒とかを設定出来無いと取りこぼすかも
思考エンジン部分はバッチで出来るだろうけどコマンドやり取りする制御部分はバッチでは厳しいかも