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国境離島警備隊は、沖縄県警機動隊から独立した警備部隊

千葉県警の成田空港警備隊のような存在
千葉県警成田空港警備隊長が千葉県警警備部参事官を兼務しているように
沖縄県警国境離島警備隊長も沖縄県警警部参事官を兼務している警視正
警察庁警備局警備運用部警備第１課課長補佐が沖縄県警に出向してきて着任した

今までは沖縄県警機動隊員や他県機動隊が海保の巡視船に同乗して事案発生に備えていたが
米軍基地予定地の警備などで沖縄県内の警備実施事案が多くなってきたことから機動隊から独立。

沖縄県警と福岡県警に離島警備隊のヘリを導入
さらに海保巡視船に同乗する警察官を離島警備隊員から充当するもの

沖縄県警国境離島警備隊の隊員の三分の一は他県警からの出向者
警察庁は沖縄県警国境離島警備隊の創設にあたり千葉県警成田空港警備隊の人員を縮小した