ET1000とET2000それぞれの外付けHDDが増えてきて、その都度ケーブル差し替えて
使うのが面倒になってきました。

個別SWつきのこういうの↓を使えるといいんだけど駄目かなあ？
センチュリー 裸族のカプセルホテル CRCH35U3IS
http://www.amazon.co.jp/dp/B00AJDKK58

今使ってるのはIOデータの電源＆FAN内蔵のUSB-HDDでHDE-U3.0J です。
可能なら紐付き状態のまま中身だけを合体ケースに移植できればベストなんだけど。