CMカット位置情報作成 join_logo_scp（単体）を久しぶりに更新したので置きました。
構成認識できなかったケースにいろいろ対応しています。
https://www.axfc.net/u/3897817.zip

[変更内容]
join_logo_scp(ver3.0)
　基本構成推測アルゴリズムを変更
　ロゴ情報をどの程度使うか数段階から選択
　自動推測した構成から手動で構成変更するコマンド追加
　ファイル先頭最後の構成認識を強化
　起動オプションの指定方法を複数追加
　実行スクリプトに機能追加多数

内部は大幅修正していますが実行ファイル（最適状態で使うならJLフォルダも）
差し替えだけでそのまま使えると思います。