なおうちで試した限りでは、tModのr2901でエンコしたものでも、
同じバージョンのMPC-HC（x64版）の内臓デコーダー＋EVR-CPで問題なく再生できる。
ソースは以下のａｖｓ。

ColorBarsHD(1280,720).Trim(0,100)
ShowFrameNumber(x=20,y=20)
f3kdb(range=0, Y=48, Cb=0, Cr=0, grainY=0, grainC=0, keep_tv_range=true, input_mode=0, input_depth=8, output_mode=2, output_depth=16)

MPC-HCの内臓ビデオデコーダー(LAV)のHardware AccelerationがNone以外になってるならNoneにして検証してみることも勧める。
（4:4:4ではDXVA等は効かないと思うが念のため）