映像音声字幕を1ファイルに一纏めにできてCMをきちんとカットできるソフトありましたら教えてください

TVMW6 字幕を1ファイルに入れられない。
Amatsukaze CM検出失敗することが多い。出力結果とログを見て毎回調整は厳しいし、調整しても失敗するものもある
PGMX CM検出機能がないので手動でCMを指定する必要がある

どれもこれも一長一短あって困ってます