>>468-469
5番の問題が発生する条件は、
・最初にデバイスファイルから読んだtsデータの中にPAT(0x0000)が存在しない
・PATの解析中にmallocがエラーを返した
・PATの解析により選択されたPMTが最初にデバイスファイルから読んだtsデータの中に存在しない
このいずれかであるようです
今回の場合は、「mallocがエラーを返した」以外の2つの条件のいずれかによるものであるでしょう
ちなみにこのいずれかの条件を満たすと、--sidオプションによる分離処理はOFFとなり、すべてのPIDをスルーするようになるみたいです

6番の問題が発生する条件は、
・最初に読んだデータの中の最初に現れたPATから選択されたPMTが0個であった
のようです
今回の場合は、最初に現れたPATがパケットエラーにより正常ではない場合に、この問題が発生していると考えられます