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何か勘違いしていないか？
軍は行政の下位機関で有り、三権から独立しているわけではない。
古代国家でも王権（行政権を含む）に従属している。

なので、軍法といえども制定は立法機関や王権によってなされ
軍自身で軍法を定めるわけではない。