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そう残念がることではありません。あくまでもAccessを
フロントエンド(入力系)に使うのはアリです。
でもデータベースのバックエンドとしてAccessを使用するのは
キケンすぎると言いたいのです。
MSDEは無償で提供されるSQL-Serverのエンジンそのものですが、
サーバー構築に必要な処理の多くをコマンドライン(Dosプロンプト)から
行う必要が出てきます。
それなりのスキルがないとできません。
見える部分はAccessで、見えない部分はMSDE　or　SQL-Serverを
使用するのが無難では？
もちろんオラクルなどの選択肢もありますが、そこまでの規模でも
ないように見うけられます。
データベースのアップサイジング(移行)は可能です。ただPostgresには
すんなり移行できないでしょうね。
良いサイトを紹介しておきます。

http://www.sqlpassj.org/begin/series/default.asp