複数の PDF を結合してひとつにまとめたはいいが、
重複するフォントが埋め込まれてしまっているため
ファイルサイズが非常に大きくなってしまった。

重複するフォントを統合してくれる、
あるいは PDF を最適化してくれるようなフリーのツールがあったら教えておくれ。