マルチになってしまうのですが、
ファイリングソフトに詳しい方に質問です。

会社でPDFを管理するためのソフトを導入しようと考えています。
以前勤めていた会社で使っていたゼロックスのdocuworksが
使いやすくインターフェイス・機能などに不満はないのですが、
今のところでは、PDFを直接扱えるもののほうが都合がよいためにいいソフトがないかと探しています。
（docuworksはXDWの独自形式のファイルですので・・・）

また、会社で保有しているPDFデータにはacrobatで入力した
「注釈」機能（矢印やｺﾒﾝﾄを入力できる機能）で入れたｺﾒﾝﾄや管理番号などが入っているので
それを同じように触れるファイリングソフトが理想です。

Docuworksにも同じような機能はありますが、
独自形式ですのでそのﾃﾞｰﾀは引き継げず、PDF→XDWにした際それを編集できる形で
認識できません。（画像？のように認識されているのだと思います）

1.PDFのまま扱える。
2.acrobatの「注釈」機能を編集・引継ぎができて、検索ができる
3.（この種のソフトによくある）ファイリングできて紙のように重ねたり、抜き出したり、入れ替えたりが視覚的に編集できる
4.サムネイル表示がされる

このような条件のソフトを探しています。
上記条件にあるソフトはないものでしょうか？