DocuWorks 9 に関する現象らしい。この説明では偶然なのか、仕様なのか、不具合なのか分からないな。

DocuWorks DeskでDocuWorks文書を「ばらす」操作をしたとき、意図しないファイルが上書きされる現象および対処方法について
h ttp://www.fujixerox.co.jp/company/news/notice/2018/0404_announce.html