フォルダコピーとISOコピーの違いがわからない。

用途としては、Blu-rayディスクに焼いた録画データのバックアップなのだが、
円盤に新たに焼いたタイトルだけをピックアップはできないということはわかった。
それならフルコピーのあと、先にコピー済みのデータを消せばいいと思ったのだが、
ISOコピーで保存すると、それができない模様。
一方フォルダコピーだと、できるみたい。

そこで最初の疑問に至ったわけだが、
ISOで保存しておかないと、後々Blu-rayの円盤に焼いてもレコーダーで再生できないとか、
なにかデメリットがあるのだろうか。
親切な人、教えてほしい。頼みます。