ver.4,70eを使ってマウスで描いています
線画を複製し、レイヤー0は白の塗りつぶしをしています。
閉鎖域の塗りつぶしや直線ツールなどの線ツールを使う場合一発で指定した色にならず、段階的に塗りつぶされていきます。（薄→濃）
ペンツールで色を塗る場合や、ルーペのペン以外のものを使っても同様です。
何か設定をいじってしまったせいなのか、わからないのですが唯一ルーペのペンだけは直接色が乗るので、やり方が間違っている可能性はありますが。

原因がわかる方、お願いいたします。