まず大まかに差分や台詞を割り振ってあるプロットを作って
そのプロットに沿って下書きしていって
下書きしてる間に段々ストーリーが脳内でまとまって肉付けられていくから、それに合わせて軌道修正しつつ全部のCGをひとまず完成させて
最後に差分に合うようにちゃんと台詞を考えて入れて、どうしても合わなかったり足りないと思ったら追加でCG書き足す