>>394
ちょっと自分も理解出来てない所があるので申し訳ない

一応、リンクで読み込んだグループを選択してctrl+alt+Pか
オブジェクトメニューから「プロキシ作成」でオブジェクトを選べば自由に動かせるようになる

グループの数にもよるけど全部プロキシ化した後、元のリンクのグループは削除した方が良いと思う
（プロキシオブジェクトを動かした後、リンクグループを動かすと変な挙動をするから）
プロキシ化したオブジェクトはまたエンプティの子供にできたり
新たにグループ化出来るのでそれで対応してみて

確かこのプロキシオブジェクトってアーマチュアとかを設定したキャラクター用の機能だったと思うけど
最近この機能使ってなくって詳細を忘れてしまった

なので詳しくは答えられないけど