inkscape:export-filename="デフォルトの保存先ディレクトリ"
inkscape:export-xdpi="96"
inkscape:export-ydpi="96"
って記述されている部分があったとして、ここは削除しても問題なく動作するので気になるのなら任意で削除。

この記述部分は Export PNG Image (Shift+Ctrl+E) のパネルから実際に書き出した場合に書き込まれるもの。
Export PNG Image の機能を最初から使わないようにすれば、書き出し先の情報がファイル内に記述されることはないよ。