Kojiさんいつもありがとうございます。
早速進捗報告版を使用しましたが、一部ファイルオープン時にエラーが出ます。

【SAI ver.】SAI Ver.2 64bit - 2020-01-07 進捗報告版
【CPU】 Core-i5-7200U
【メモリ】12GB
【OS】Windows 10 Home 64
【タブ】 未使用､ WindowsInk対応ペン使用
【タブドライバver.】 windowsAPIで使用
【再現手順】
sai2-20190812-64bit-jaで作成した「ペン入れレイヤ−」を持つファイルのうち、いくつかで（全てではないようです）開くと同時にエラーメッセージが出ます。
　「プログラムの内部状態に異常が発生しました。」
　（ここに開こうとしたファイルフルパス名が表示されます。）
その後もう一度同じファイルを開こうとすると
#108 プログラム内部で不正な…
#109 プログラム内部で不正な…
#110 プログラム内部で不正な…
といった小さなメッセージが右下に表示されますが、一応ファイルが開かれます。
エラーが出るとペン入れレイヤーが真っ白になっている場合が多いです。