http://www.sqlite.org/lang_delete.html

>Optional LIMIT and ORDER BY clauses
>
>If SQLite is compiled with the SQLITE_ENABLE_UPDATE_DELETE_LIMIT compile-time option,
>then the syntax of the DELETE statement is extended by the addition of optional
>ORDER BY and LIMIT clauses:

ご使用になっている SQLite3 は SQLITE_ENABLE_UPDATE_DELETE_LIMIT オプションを付けて
コンパイルされたものではないのでしょう。