無駄なものは置かない。(アイコンなども)
Shellそのものを自分好みに書き換える。
全体的に統一感を持たす。

これだけでもかなり良くなるよ。
私は半々くらいだけど極力デスクトップにはアイコンは置かない。
何もソフトを開いていないときは壁紙だけになるようにしている。

タスクバーは側面に置きアイコンひとつ分の幅に。
こうすると開いているアプリケーションの説明は見えないが、
私個人に限ってはそれでも何も困らないのでむしろシンプルで、
わかりやすく画面領域を広く使えて良い。
この置き方をするとアプリケーションを20個くらい開いても、
タスクバーに収まりきっているので。(実際に開くのは一桁だけど)