今の GYAO! が使っている配信プロトコルが HLS だから、
その規約に従うとコーデックは MPEG2 TS しか選択肢がないんだわ。
MP4 にするだけで (同程度の画質で) ファイルサイズは半分程度に出来るというか、
以前は MP4 で配信してたから大量に回収してる人にとってはストレージを圧迫してつらい。